Questa volta abbiamo cercato una curiosità scientifica :
IO'ho letto in numerosi articoli che SARS-CoV-2 ha un basso tasso di mutazione perché i corona virus controllano il loro RNA copiato per errori.
Pensavo che i virus usassero i processi interni delle cellule che invadono per gestire la replicazione, quindi ciò che è “lettura di prova” la replica come prima della replicazione il virus non ha prodotto proteine proprie.
Ed ecco le risposte degli esperti:
Quindi, prima di tutto non sei poi così lontano. In generale, i virus hackerano i meccanismi della cellula per replicarsi. Ma quasi tutti i virus hanno un genoma virale che codifica per poche, o in alcuni casi molte, proteine. Tutto dipende solo dal virus, dalla sua storia evolutiva e dal tipo di genoma (Dna a filamento singolo, DNA a doppio filamento, +/- Rna). Purtroppo questo coronavirus ha in realtà il codice genetico per creare un complesso proteico per la correzione di bozze dell'RNA (pazzo vero!?!) Quindi in questo caso il virus stesso fornisce le proteine per la correzione di bozze durante la replicazione, causando la relativamente bassa frequenza di mutazioni in generale perché è un virus, si replicano velocemente ed entrano velocemente in nuovi ambienti)
Questo rende anche difficile il targeting covid con i farmaci poiché molti dei migliori farmaci antivirali funzionano ingannando i virus che non eseguono la correzione di bozze per incorporare un nucleoside ingombrante, non facile da lavorare invece di uno normale nel suo genoma. Questi “analoghi nucleosidici” guardano al virus che non legge come un normale ATCG ma sono modificati chimicamente per terminare la reazione. Quindi, se tu come virus incorpori un analogo nucleosidico, allora è un peccato, ora ti viene impedito di replicare. Covid può dire che hanno raccolto un analogo nucleosidico invece di un normale nucleoside, elimineranno l'analogo, e quindi i nostri migliori antivirali non possono impedire a covid di fare ciò che è. )
Per chiarire parti del genoma dell'RNA virale vengono prima tradotte dall'ospite in proteine prima della successiva replicazione / trascrizione. Quelle proteine includerebbero macchine per la lettura di bozze.
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In primo luogo, sebbene ci siano errori nella replicazione dell'RNA senza correzione di bozze, il tasso di errore è solo 15 – 20 volte superiore.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ 21593585 /
Per la seconda parte della tua domanda:
> cos'è “lettura di prova” la replica come prima della replica il virus non ha prodotto proteine proprie
Niente , la correzione di bozze avverrebbe solo se le proteine di correzione (in particolare nsp – 14 e ExoN) sono presenti.
Dopo che il virus ha infettato una cellula, il suo genoma non viene rivestito dalle vescicole intracellulari ed è immediatamente sottoposto alla traduzione da parte della macchina ospitante. Solo dopo questo periodo iniziale di espressione sarebbe avvenuta la correzione di bozze per la successiva replicazione dell'RNA.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC 7592455 /
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In sostanza, devi capire che esiste un livello di selezione purificante accadendo sul genoma virale. Se il virus acquisisce mutazioni deleterie nel suo genoma, non sarà in grado di sopravvivere e riprodursi, con il risultato che il suo genoma non verrà propagato in futuro. Quindi, anche se le repliche iniziali del genoma dell'RNA presentano errori, verranno trasmessi solo i genomi funzionali.
TL;DR – After il virus infetta una cellula produce le proteine di correzione prima di replicare il proprio genoma
I virus a RNA devono codificare la propria proteina di copia dell'RNA. Sembra che tutti i virus a RNA siano correlati perché usano tutti la stessa proteina. I coronavirus sono speciali in quanto hanno anche una proteina separata che si complessa con la proteina di copiatura per eseguire la correzione di bozze. I coronavirus sono virus a RNA a filamento singolo positivi. I loro genomi imitano l'm-RNA e possono essere tradotti direttamente in protie dai ribosomi. Quindi prima viene costruito il complesso di copia, quindi il genoma inizia a essere copiato.